总体上，孩子的感染以病毒感染占明显优势。随着包括肺炎疫苗在内的多种疫苗的接种，细菌感染的比例越来越小。

早期的细菌和病毒感染临床表现差异不大。相对而言，细菌感染的中毒症状相对严重一点（中毒症状包括：精神萎靡、淡漠、烦躁不安、持续发热不退、肤色苍白、不愿和家人交流等），发生严重后果的比例相对高一点（肺炎、脑膜炎、败血症等）。但是部分重症的病毒感染同样致命（比如重症手足口病和爆发性心肌炎等）。

目前医学界没有一个能快速精确分辨感染是细菌还是病毒的方法。所以判断孩子是细菌还是病毒感染一直是对医生的考验，但可以肯定的是一张血常规和CRP是无法承担确定感染是病毒还是细菌的重任（有时甚至是误导），单纯依靠血常规和CRP结果判断感染类型是导致抗生素滥用的一个重要原因。